民國八十九年二月，因應精省之故，省立高中職校改隸教育部，本校改名為「國立竹北高級中學」，八月，連校長榮退。暫由教務主任曾文料代理校長職務。八月二十二日，教育部遴聘國立清水高中學務主任匡格非接任校長。
匡校長非常重視學生的人文素養與國際視野，除繼續軟硬體設施改善外，堅信每一位學生都會成央F給學生成就與肯定會增強其信心。根據這樣的理念推展校務，九十年，成立竹苗區學校第一支儀隊，與加拿大亞伯特省齊諾克學院簽定合作契約，辦海外暑期英語研習營，將體育績優生改設體育班，辦理全國校長會議，連續三年辦理校園健康營造，推展日韓國際教育旅行，並與韓國大田外國語高中、忠南高中締結姊妹校，成立數理及語文實驗班，大力提倡夜間晚自習風氣。資、商學程班和資訊商經科也在師生的努力下，躍居全國第一，九十五年普通班升學成績大放異彩。 開展竹北多元、自信、創新、活力和國際化的新面貌。
硬體方面，除繼續整修環境更新設備外，九十一年三月，因豆子埔溪整治，運動場地縮減，與新竹縣政府協商，更改原來設計，規劃足夠運動空間，並徵收學校後方土地，作為將來學生運動場地。游泳池、曙U委外經營，每年增加學校收入約兩百萬元，太陽能和遮陽工程及資源屋、透水鋪面等永續校園設置，開啟新校園面貌。另外，設置圖書館的藝文空間，規劃校園公共藝術等。
